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Paketbeschreibung


Paketnameamap-align
BeschreibungProtein multiple alignment by sequence annealing
Archiv/RepositoryOffizielles Ubuntu Archiv lucid (universe)
Version2.2-1
Sektionuniverse/science
Prioritätoptional
Installierte Größe304 Byte
Hängt ab vonlibc6 (>= 2.4), libgcc1 (>= 1:4.1.1-21), libstdc++6 (>= 4.2.1-4)
Empfohlene Pakete
PaketbetreuerUbuntu MOTU Developers
Quelle
Paketgröße124896 Byte
Prüfsumme MD5cebe062ccc37e8489cd98d543a2ed813
Prüfsumme SHA1223b1a1907ba9ba8aae99aa5f732691e186739b6
Prüfsumme SHA25612b73c1bf522cd85f5777ee528933ccba3446384d26a394e7a074467fa975ac3
Link zum Herunterladenamap-align_2.2-1_i386.deb
Ausführliche BeschreibungAMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation. . The java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.


Impressum
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